Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn3Q499D0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms