Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Usp48Q3V0C5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Usp48Q3V0C5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Usp48Q3V0C5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Usp48Q3V0C5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Usp48Q3V0C5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Usp48Q3V0C5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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