Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms