Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms