Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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