Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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