Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms