Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms