Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms