Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Cops9Q3U898 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Cops9Q3U898 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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