Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms