Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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