Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms