Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms