Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms