Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS87

9130409I23Rik, MCG19844, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130409I23RikQ3TS87 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
9130409I23RikQ3TS87 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9130409I23RikQ3TS87 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms