Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms