Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms