Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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