Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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