Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms