Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam178bQ24JP3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam178bQ24JP3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam178bQ24JP3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam178bQ24JP3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam178bQ24JP3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam178bQ24JP3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam178bQ24JP3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam178bQ24JP3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam178bQ24JP3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam178bQ24JP3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam178bQ24JP3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam178bQ24JP3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam178bQ24JP3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam178bQ24JP3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam178bQ24JP3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam178bQ24JP3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam178bQ24JP3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam178bQ24JP3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms