Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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Shroom4Q1W617 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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Shroom4Q1W617 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shroom4Q1W617 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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