Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms