Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam171bQ14CH0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms