Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ptchd1Q14B62 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ptchd1Q14B62 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ptchd1Q14B62 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ptchd1Q14B62 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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