Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms