Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms