Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms