Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5bQ0V8T8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms