Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms