Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms