Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms