Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms