Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms