Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms