Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms