Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms