Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms