Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms