Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms