Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms