Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms