Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms