Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms