Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms