Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mmp11Q02853 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mmp11Q02853 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mmp11Q02853 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mmp11Q02853 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mmp11Q02853 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Mmp11Q02853 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Mmp11Q02853 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Mmp11Q02853 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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