Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms