Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms