Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VcpQ01853 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VcpQ01853 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms